 Thomas
|
3c15a2820a
bam annotation par
|
преди 5 дни |
|
Thomas
|
4bbbc66981
Introducing new executor that takes a Vec<Vec<AnyJob>> and treat the inner vec as a sequence.jobs_seq![..] helps to define this sequence from any job that implement LocalRunner and SbatchRunner. ClairS implementation and new resume chunked (TODO: add clairs_allow_resume in config.
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
bf12d05d90
longcallD
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
3e63458572
merge
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
dcd1aa64f7
assembler pipe with recursion
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
44067c4310
assembler pipe
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
b85b028475
coral
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
d6250eeae7
coral
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
9ddb488f87
robuster epilog parsing
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
22d9b9f29d
savana_mem for slurm max mem
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
f216c34dce
reduced clairS threads; added slurm_max_par default: 10; use of run! and run_many! in bam import
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
27489a85bc
config;panel_bam
|
преди 1 месец |
|
Thomas
|
069f6f8b38
Added GATK mutect2
|
преди 3 месеца |
|
Thomas
|
66faf6060c
upgraded jobs names with part index
|
преди 4 месеца |
|
Thomas
|
d17bbe3ad5
limit clairs threads
|
преди 4 месеца |
|
Thomas
|
0278ed4c64
improved somatic pipe
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
035d9d3741
config: added IGV and viz required files
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
b2f8ba29dd
config: added db_snp
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
7ba042df8d
update
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
5aabb5de5b
dict file
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
6f12252396
prom runs
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
fbb733ef00
prom runs
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
c3b5e356bf
echtvar
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
30faf74aa1
nanomonsv MA
|
преди 5 месеца |
|
Thomas
|
244ff9366f
nanomonsv MA
|
преди 6 месеца |
|
Thomas
|
081a1b411b
straglr somatic change
|
преди 6 месеца |
|
Thomas
|
8e7e1df6bc
Update callers and config
|
преди 6 месеца |
|
Thomas
|
a020475b87
fbinv
|
преди 6 месеца |
|
Thomas
|
9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
|
преди 6 месеца |
|
Thomas
|
b135d60d4e
callers
|
преди 6 месеца |
