 Thomas
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334057b7e1
merge
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hace 2 semanas |
 STEIMLE Thomas
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52d9e6486b
Add block-compressed Pandora variant index
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hace 2 semanas |
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STEIMLE Thomas
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87009c3474
Add Pandora SomaticPipe output container
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hace 2 semanas |
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Thomas
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a0f6db44b0
multiallelic normalization (just for INFO FREQ of dbsnp) for fetch_vcf, prefer normalized vcf...
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hace 1 mes |
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Thomas
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a1ab3e9dc6
dbg
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hace 1 mes |
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Thomas
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478f26daf0
improved BAM INS detection
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hace 4 meses |
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Thomas
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0278ed4c64
improved somatic pipe
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hace 5 meses |
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Thomas
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4cfdd15a5d
dict file
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hace 5 meses |
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Thomas
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fbb733ef00
prom runs
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hace 5 meses |
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Thomas
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955bd9fc0e
scan
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hace 5 meses |
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Thomas
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30faf74aa1
nanomonsv MA
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hace 5 meses |
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Thomas
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1f42f2b8ef
Pod5sFlowCell
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hace 6 meses |
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Thomas
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708d1fefb3
INSERTION depth wrong
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hace 9 meses |
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Thomas
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e7a639d582
somatic pipeline should run added bam modification trigger
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hace 11 meses |
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Thomas
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1698753921
somatic pipeline should run
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hace 11 meses |
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Thomas
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3604b225cf
BND to del
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hace 1 año |
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Thomas
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e8b86f0d83
annot repeatmasker
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hace 1 año |
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Thomas
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74c6f4da7b
bam alt/depth
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hace 1 año |
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Thomas
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49a95012cf
Annotation::VNTR
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hace 1 año |
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Thomas
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a4df568492
bedrow overlaps par
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hace 1 año |
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Thomas
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87a576356b
filter mapq
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hace 1 año |
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Thomas
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c69dcf818c
filter mapq
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hace 1 año |
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Thomas
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86513cba22
VCF write
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hace 1 año |
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Thomas
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4c5672cc47
stats + callers() + bed compare
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hace 1 año |
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Thomas
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23d0e0ea17
Trinucleotides and Early/Late annotations
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hace 1 año |
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Thomas
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a5880b4b84
caller bug // callers shoud run info // remove_dir_if_exists
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hace 1 año |
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Thomas
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03ec589273
macro and function for trait Should Run
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hace 1 año |
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Thomas
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0b6f1f3ffe
working scan no mem leaks because of pileup
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hace 1 año |
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Thomas
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980c173f72
variants rates + ncbi versions
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hace 1 año |
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Thomas
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9d84177b64
gz_writer + variants_stats + high depth ranges + BinCount depths + Bin depths
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hace 1 año |
