 Thomas
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354d5c9a42
upated straglr job_name to refelct the sample and part
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vor 6 Tagen |
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Thomas
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fc28b7c1a7
m
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vor 6 Tagen |
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Thomas
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1ce719023c
better concurrency in job execution
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vor 6 Tagen |
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Thomas
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6a81179dfb
added SomaticScan in callers pipe
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vor 1 Woche |
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Thomas
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538e30df2e
added should_run for LongphaseHap run
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vor 1 Woche |
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Thomas
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72159af3ec
bug HP bam double suffixe
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vor 1 Woche |
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Thomas
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66faf6060c
upgraded jobs names with part index
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vor 1 Woche |
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Thomas
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95062589e6
limit clairs mem
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vor 1 Woche |
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Thomas
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d17bbe3ad5
limit clairs threads
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vor 1 Woche |
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Thomas
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a6e037983f
limit max sbatch in paral for run_many_sbatch
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vor 1 Woche |
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Thomas
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93f5594588
rm lock in chunked run fn
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vor 1 Woche |
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Thomas
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85fae9dc92
should_run befor lock
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vor 1 Woche |
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Thomas
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30c12c86c4
Repat annoation
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vor 1 Woche |
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Thomas
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c2301c5f98
one source of hash
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vor 1 Woche |
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Thomas
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478f26daf0
improved BAM INS detection
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vor 1 Woche |
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Thomas
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0278ed4c64
improved somatic pipe
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vor 2 Wochen |
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Thomas
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91263c0e19
somatic_depth_quality_ranges bug fix
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vor 2 Wochen |
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Thomas
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f6064be4ee
somatic_depth_quality_ranges bug fix
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vor 2 Wochen |
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Thomas
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fc120e0876
GenesBedIndex comment + rm sort dedup
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vor 2 Wochen |
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Thomas
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ff594b7c02
GenesBedIndex
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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035d9d3741
config: added IGV and viz required files
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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b2f8ba29dd
config: added db_snp
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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bd6db971e1
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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25bfac95c9
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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e7b0a55cc8
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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b3419d89e0
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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7ba042df8d
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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af50b44ea0
update VEP
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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61e40ca4b2
update
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vor 3 Wochen |
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Thomas
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ae20fc03a4
update
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vor 3 Wochen |
