 Thomas
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63632f0b37
keep ancient mtime when modifying BAM header for adding SM tag in Mutect2
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hai 3 semanas |
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Thomas
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5133ac3efd
liftover
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hai 1 mes |
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Thomas
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478f26daf0
improved BAM INS detection
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hai 1 mes |
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Thomas
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b3419d89e0
update
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hai 2 meses |
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Thomas
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7ba042df8d
update
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hai 2 meses |
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Thomas
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04885bee38
update
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hai 2 meses |
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Thomas
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211191d148
doc update
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hai 2 meses |
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Thomas
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e516dd6b4d
nanomonsv tested
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hai 2 meses |
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Thomas
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403d80572c
Update Pod5sRun
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hai 3 meses |
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Thomas
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89fea92bf5
config toml
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hai 3 meses |
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Thomas
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37caffae61
upate version checker
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hai 4 meses |
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Thomas
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f3afe60575
hts up
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hai 6 meses |
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Thomas
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708d1fefb3
INSERTION depth wrong
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hai 6 meses |
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Thomas
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1a306f5e24
BNDdesc with BNDGraph // Scan verify if bam exists // depth at
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hai 10 meses |
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Thomas
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c744ed35cf
Flowcells load gz
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hai 11 meses |
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Thomas
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980c173f72
variants rates + ncbi versions
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hai 11 meses |
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Thomas
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f3dda27be5
bitcode
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hai 1 ano |
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Thomas
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e09d58cbdb
variants final stats
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hai 1 ano |
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Thomas
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15c96c308f
arrow up
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hai 1 ano |
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Thomas
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f711af1838
rm podders
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hai 1 ano |
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Thomas
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1521d68dae
up
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hai 1 ano |
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Thomas
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d361ec6c1d
comments
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hai 1 ano |
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Thomas
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b94e086725
machete
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hai 1 ano |
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Thomas
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9e37c42646
opt build
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hai 1 ano |
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Thomas
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605ee768fb
json somatic stats
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hai 1 ano |
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Thomas
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62bb510dba
cleared syntax
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hai 1 ano |
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Thomas
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add4a2ecc9
entropy filter // echtvar annotate
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hai 1 ano |
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Thomas
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45e1063e97
filters BAM finished (del pos + 1) // begin ExternalAnnotations
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hai 1 ano |
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Thomas
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4c2b6e5fa5
sankey charming
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hai 1 ano |
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Thomas
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e01ab06376
somatic pipeline / blake3 128 for annotations hash / seq from fasta at position +/- len, entropy
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hai 1 ano |
