 Thomas
|
63632f0b37
keep ancient mtime when modifying BAM header for adding SM tag in Mutect2
|
před 3 týdny |
|
Thomas
|
5133ac3efd
liftover
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
478f26daf0
improved BAM INS detection
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
b3419d89e0
update
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
7ba042df8d
update
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
04885bee38
update
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
211191d148
doc update
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
e516dd6b4d
nanomonsv tested
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
403d80572c
Update Pod5sRun
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
89fea92bf5
config toml
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
37caffae61
upate version checker
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
f3afe60575
hts up
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
1a306f5e24
BNDdesc with BNDGraph // Scan verify if bam exists // depth at
|
před 10 měsíci |
|
Thomas
|
980c173f72
variants rates + ncbi versions
|
před 11 měsíci |
|
Thomas
|
f3dda27be5
bitcode
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
e09d58cbdb
variants final stats
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
15c96c308f
arrow up
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
f711af1838
rm podders
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
1521d68dae
up
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
18e6fbf0f8
up
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
b94e086725
machete
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
9e37c42646
opt build
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
605ee768fb
json somatic stats
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
62bb510dba
cleared syntax
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
add4a2ecc9
entropy filter // echtvar annotate
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
45e1063e97
filters BAM finished (del pos + 1) // begin ExternalAnnotations
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
4c2b6e5fa5
sankey charming
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
e01ab06376
somatic pipeline / blake3 128 for annotations hash / seq from fasta at position +/- len, entropy
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
710bd6515c
annotations
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
14c829fadf
up dorado 0.9.0: added sequencing kit name for trim
|
před 1 rokem |
