 Thomas
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8e7e1df6bc
Update callers and config
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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453f3db650
stats variants
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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116b2d7111
vcf_variants
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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a020475b87
fbinv
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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25db0587a1
callers staglr
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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cab2f12c20
callers staglr
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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c0060e3f5a
callers
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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b135d60d4e
callers
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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901d8e4963
pipe metrics
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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848e7845ba
deep_somatic update
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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5e4e7c0275
run and run_many macro
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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361c8f3e6b
up
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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8b2c676daf
up
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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78f31bc229
PromRun
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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c331485a10
import_run update
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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a7e83647b8
ClairS update
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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6c52a16a21
SamtoolsMergeMany, slurm_pipe/import upate
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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4ac495035c
ClairS upate
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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8dd3c41065
DeepVariant upate
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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0409a892e8
ClairS slurm
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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0d26c83b3e
BcfTools Slurm
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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59232e836c
Update DeepVariant for slurm
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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8e8ec39f18
Add run method
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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40524fefc7
Update runs for unligned BAM files and not only POD5
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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0a1d0d4be3
Update Pod5sRun
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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403d80572c
Update Pod5sRun
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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3c19136885
Full somatic POD5s basecalling and alignment based on case_id
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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79ef966d5d
Pod5
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vor 6 Monaten |
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Thomas
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cd293aa117
Pod5Info corupted file skipping
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vor 6 Monaten |
