 Thomas
|
91aa4d1732
archives
|
6 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
4a0b1676c2
compo
|
7 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
8fed952f37
bam add fn tag in compo
|
7 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
3c1d73bab5
bam_has_fc
|
7 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
3604b225cf
BND to del
|
7 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
1a306f5e24
BNDdesc with BNDGraph // Scan verify if bam exists // depth at
|
8 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
0b6f1f3ffe
working scan no mem leaks because of pileup
|
8 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
2aefa191ed
up
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
fde4568495
vep stats
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
b94e086725
machete
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
043deb5e1b
default
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
b793b4a698
N50 and size for BAMStats
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
605ee768fb
json somatic stats
|
10 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
4c2b6e5fa5
sankey charming
|
11 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
80ba19f211
annotate_with_constit_bam (HighConstitAlt + LowConstitDepth) // counts_ins_at // alteration cat
|
11 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
e01ab06376
somatic pipeline / blake3 128 for annotations hash / seq from fasta at position +/- len, entropy
|
11 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
3085d82cfd
typst fmt
|
11 kuukautta sitten |
|
Thomas
|
af8fd4c4d4
up
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
62265a008b
DMR
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
|
1 vuosi sitten |
 Your Name
|
d08c603a67
bam info json
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
a01bc92739
bam_ok
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
56eb3a92eb
scan
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
bc7592003b
update
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
2073c9ecf8
context + dedup tasks
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
5f479db5bc
vcf tasks ok, refactor CommandRun
|
1 vuosi sitten |
|
Thomas
|
5fbf2203ff
project refactor
|
1 vuosi sitten |
