 Thomas
|
ae3d3c1ee9
modkit
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
43eef222eb
error handling
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
6cb25899fa
dorado up to 0.8.1 changed demuxed names so new fn to find the bam file
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
63c5922d5d
todo_variants_agg tested
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
b8dfc87b1e
dorado 0.8.1 cuda devices
|
vor 1 Jahr |
 Your Name
|
57fe3f17d2
up
|
vor 1 Jahr |
|
Your Name
|
d08c603a67
bam info json
|
vor 1 Jahr |
|
Your Name
|
7f527d5b74
whole_scan
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
386de7c96a
bam_ok
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
a01bc92739
bam_ok
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
2073c9ecf8
context + dedup tasks
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
092d2ae2dd
rm vcf
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
1426319ce6
static DOCKER_ID
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
5f479db5bc
vcf tasks ok, refactor CommandRun
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
5fbf2203ff
project refactor
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
86dfefc30a
vcf tasks
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
44dd4ff144
clairs
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
63fc4f96cf
docker runner, deep_var
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
370a7c9ec0
acquisition ID from pileup
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
39730822d3
demux + merge
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
02ec23c7ae
clean
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
bbc7d3ebf2
c
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
46f19b16f5
ok
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
494efb6235
run
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
b74a501c6c
bams
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
0515438ca5
bams
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
62d7b32549
todo
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
bd52951a17
full
|
vor 1 Jahr |
|
Thomas
|
0776ccd633
dir
|
vor 1 Jahr |
