 Thomas
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ae3d3c1ee9
modkit
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hai 1 ano |
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Thomas
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e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
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hai 1 ano |
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Thomas
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43eef222eb
error handling
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hai 1 ano |
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Thomas
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bf79d554e2
up bcftools
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hai 1 ano |
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Thomas
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b06901c8a1
better tasks runner
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hai 1 ano |
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Thomas
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948ba7454f
info
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hai 1 ano |
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Thomas
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6cb25899fa
dorado up to 0.8.1 changed demuxed names so new fn to find the bam file
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hai 1 ano |
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Thomas
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63c5922d5d
todo_variants_agg tested
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hai 1 ano |
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Thomas
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f56aa5599c
todo_variants_agg
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hai 1 ano |
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Thomas
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b8dfc87b1e
dorado 0.8.1 cuda devices
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hai 1 ano |
 Your Name
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57fe3f17d2
up
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hai 1 ano |
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Your Name
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a4c7719e04
bam info json
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hai 1 ano |
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Your Name
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d08c603a67
bam info json
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hai 1 ano |
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Your Name
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7f527d5b74
whole_scan
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hai 1 ano |
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Thomas
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386de7c96a
bam_ok
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hai 1 ano |
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Thomas
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a01bc92739
bam_ok
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hai 1 ano |
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Thomas
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56eb3a92eb
scan
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hai 1 ano |
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Thomas
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bc7592003b
update
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hai 1 ano |
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Thomas
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b1c73a178e
update
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hai 1 ano |
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Thomas
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2073c9ecf8
context + dedup tasks
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hai 1 ano |
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Thomas
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e5983bca9a
m
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hai 1 ano |
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Thomas
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092d2ae2dd
rm vcf
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hai 1 ano |
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Thomas
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1426319ce6
static DOCKER_ID
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hai 1 ano |
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Thomas
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9ceab0f209
report
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hai 1 ano |
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Thomas
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5f479db5bc
vcf tasks ok, refactor CommandRun
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hai 1 ano |
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Thomas
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5fbf2203ff
project refactor
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hai 1 ano |
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Thomas
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86dfefc30a
vcf tasks
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hai 1 ano |
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Thomas
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44dd4ff144
clairs
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hai 1 ano |
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Thomas
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63fc4f96cf
docker runner, deep_var
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hai 1 ano |
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Thomas
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370a7c9ec0
acquisition ID from pileup
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hai 1 ano |
