 Thomas
|
d17bbe3ad5
limit clairs threads
|
před 1 týdnem |
|
Thomas
|
0278ed4c64
improved somatic pipe
|
před 2 týdny |
|
Thomas
|
035d9d3741
config: added IGV and viz required files
|
před 3 týdny |
|
Thomas
|
b2f8ba29dd
config: added db_snp
|
před 3 týdny |
|
Thomas
|
7ba042df8d
update
|
před 3 týdny |
|
Thomas
|
5aabb5de5b
dict file
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
6f12252396
prom runs
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
fbb733ef00
prom runs
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
c3b5e356bf
echtvar
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
30faf74aa1
nanomonsv MA
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
244ff9366f
nanomonsv MA
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
081a1b411b
straglr somatic change
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
8e7e1df6bc
Update callers and config
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
a020475b87
fbinv
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
b135d60d4e
callers
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
848e7845ba
deep_somatic update
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
5e4e7c0275
run and run_many macro
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
8b2c676daf
up
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
78f31bc229
PromRun
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
6c52a16a21
SamtoolsMergeMany, slurm_pipe/import upate
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
8dd3c41065
DeepVariant upate
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
0409a892e8
ClairS slurm
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
0d26c83b3e
BcfTools Slurm
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
59232e836c
Update DeepVariant for slurm
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
3c19136885
Full somatic POD5s basecalling and alignment based on case_id
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
ba99b771cc
rm collections
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
4de4f971fe
In the CLUSTER !!!
|
před 2 měsíci |
|
Thomas
|
89fea92bf5
config toml
|
před 2 měsíci |
