 Thomas
|
44067c4310
assembler pipe
|
8 timmar sedan |
|
Thomas
|
947fe471aa
save_into_lifted for Variants
|
2 månader sedan |
|
Thomas
|
7ba042df8d
update
|
3 månader sedan |
|
Thomas
|
211191d148
doc update
|
4 månader sedan |
|
Thomas
|
116b2d7111
vcf_variants
|
4 månader sedan |
|
Thomas
|
9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
|
4 månader sedan |
|
Thomas
|
0d26c83b3e
BcfTools Slurm
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
59232e836c
Update DeepVariant for slurm
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
5d8b2bf45e
Pod5sRuns
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
671e2ea3db
no warning
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
1f42f2b8ef
Pod5sFlowCell
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
ba99b771cc
rm collections
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
4de4f971fe
In the CLUSTER !!!
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
89fea92bf5
config toml
|
5 månader sedan |
|
Thomas
|
37caffae61
upate version checker
|
6 månader sedan |
|
Thomas
|
708d1fefb3
INSERTION depth wrong
|
8 månader sedan |
|
Thomas
|
5d43d529e8
better bam_compo // WGSBamStats
|
9 månader sedan |
|
Thomas
|
929c95c2d3
is file older now remove dir if so// DeepSomatic passed vcf path was wronggly pointing into DeepVariant mrd folder // nanomonsv is file older now check mrd and passed diag if older of respective bam
|
10 månader sedan |
|
Thomas
|
def4247123
DUPLICATION not for serverus
|
10 månader sedan |
|
Thomas
|
418c754b01
DUPLICATION
|
10 månader sedan |
|
Thomas
|
0e1603298a
flowcells sort by modified
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
cf7c41a98c
dorardo up and emit-moves
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
b28a6f37b0
savana alt/depth from info, added n_alt_depth for info and above for vcf_variant
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
cc0ef4fcbe
Bug deletion desc when coming from BNDdesc
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
3604b225cf
BND to del
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
e8b86f0d83
annot repeatmasker
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
74c6f4da7b
bam alt/depth
|
11 månader sedan |
|
Thomas
|
a4df568492
bedrow overlaps par
|
1 år sedan |
|
Thomas
|
17e88bd514
deletion desc n alt depth
|
1 år sedan |
|
Thomas
|
5a323d50bc
clearer parse bnddesc
|
1 år sedan |
