 Thomas
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6e963786e3
no gvcf for deep callers
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hace 7 meses |
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Thomas
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b485ce70a9
ctrlc ignore err if already set
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hace 7 meses |
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Thomas
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258e2a5172
up deepvariant deepsomatic
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hace 7 meses |
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Thomas
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043ce2f1d4
up deepvariant deepsomatic
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hace 7 meses |
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Thomas
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4a0b1676c2
compo
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hace 7 meses |
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Thomas
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8fed952f37
bam add fn tag in compo
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hace 7 meses |
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Thomas
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3c1d73bab5
bam_has_fc
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hace 7 meses |
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Thomas
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8f2710b5ae
dorado err
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hace 7 meses |
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Thomas
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45d35dec76
savana alt/depth from info, added n_alt_depth for info and above for vcf_variant
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hace 7 meses |
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Thomas
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b28a6f37b0
savana alt/depth from info, added n_alt_depth for info and above for vcf_variant
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hace 7 meses |
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Thomas
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8783ace12a
Fix sub constit del depth
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hace 7 meses |
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Thomas
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cc0ef4fcbe
Bug deletion desc when coming from BNDdesc
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hace 7 meses |
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Thomas
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440fcd1a83
DELINV
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hace 7 meses |
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Thomas
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3604b225cf
BND to del
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hace 7 meses |
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Thomas
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e8b86f0d83
annot repeatmasker
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hace 7 meses |
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Thomas
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74c6f4da7b
bam alt/depth
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hace 7 meses |
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Thomas
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49a95012cf
Annotation::VNTR
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hace 7 meses |
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Thomas
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c4142d40fa
deletion len
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hace 7 meses |
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Thomas
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cfad55ca3e
deletion len
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hace 7 meses |
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Thomas
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21eeae81ae
deletion len
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hace 7 meses |
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Thomas
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300db208af
variant and VEP access methods
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hace 7 meses |
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Thomas
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a4df568492
bedrow overlaps par
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hace 7 meses |
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Thomas
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a1a2c6e8d0
mean_alt_depth
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hace 7 meses |
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Thomas
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17e88bd514
deletion desc n alt depth
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hace 7 meses |
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Thomas
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5a323d50bc
clearer parse bnddesc
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hace 7 meses |
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Thomas
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9157716ac1
find file
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hace 7 meses |
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Thomas
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6054343630
group_variants_by_bnd_rc
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hace 7 meses |
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Thomas
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c0b4e2964c
variant callers
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hace 7 meses |
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Thomas
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eba1b016d6
variant callers
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hace 7 meses |
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Thomas
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3eeb7b514b
group_variants_by_bnd_desc
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hace 7 meses |
