 Thomas
|
7941d95fdc
depths
|
3 tuần trước cách đây |
|
Thomas
|
24d129c5a8
colorsdb update
|
1 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
0aaeaf8ce8
colorsdb annotation
|
1 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
3c15a2820a
bam annotation par
|
1 tháng trước cách đây |
 STEIMLE Thomas
|
1fcf1c5c22
Apply formatting cleanup
|
2 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
4bbbc66981
Introducing new executor that takes a Vec<Vec<AnyJob>> and treat the inner vec as a sequence.jobs_seq![..] helps to define this sequence from any job that implement LocalRunner and SbatchRunner. ClairS implementation and new resume chunked (TODO: add clairs_allow_resume in config.
|
2 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
bf12d05d90
longcallD
|
2 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
3e63458572
merge
|
2 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
dcd1aa64f7
assembler pipe with recursion
|
2 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
44067c4310
assembler pipe
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
b85b028475
coral
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
d6250eeae7
coral
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
22d9b9f29d
savana_mem for slurm max mem
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
f216c34dce
reduced clairS threads; added slurm_max_par default: 10; use of run! and run_many! in bam import
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
27489a85bc
config;panel_bam
|
3 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
069f6f8b38
Added GATK mutect2
|
5 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
035d9d3741
config: added IGV and viz required files
|
6 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
b2f8ba29dd
config: added db_snp
|
6 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
fbb733ef00
prom runs
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
c3b5e356bf
echtvar
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
f977672ffe
config from_path
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
627c8ddef3
config from_path
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
30faf74aa1
nanomonsv MA
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
244ff9366f
nanomonsv MA
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
081a1b411b
straglr somatic change
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
a020475b87
fbinv
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
cab2f12c20
callers staglr
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
b135d60d4e
callers
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
848e7845ba
deep_somatic update
|
7 tháng trước cách đây |
|
Thomas
|
5e4e7c0275
run and run_many macro
|
7 tháng trước cách đây |
