 Thomas
|
dce4a111cc
nanomonsv -> mediumq; GATK ok
|
před 5 dny |
|
Thomas
|
9ddb488f87
robuster epilog parsing
|
před 6 dny |
|
Thomas
|
f216c34dce
reduced clairS threads; added slurm_max_par default: 10; use of run! and run_many! in bam import
|
před 1 týdnem |
|
Thomas
|
e5838fa74e
lim s batch para
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
66faf6060c
upgraded jobs names with part index
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
d17bbe3ad5
limit clairs threads
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
a6e037983f
limit max sbatch in paral for run_many_sbatch
|
před 3 měsíci |
|
Thomas
|
fbb733ef00
prom runs
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
a020475b87
fbinv
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
b135d60d4e
callers
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
5e4e7c0275
run and run_many macro
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
0409a892e8
ClairS slurm
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
0d26c83b3e
BcfTools Slurm
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
40524fefc7
Update runs for unligned BAM files and not only POD5
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
671e2ea3db
no warning
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
ba99b771cc
rm collections
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
4de4f971fe
In the CLUSTER !!!
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
93ee5d1c5e
up dorado
|
před 9 měsíci |
|
Thomas
|
b692aefa9a
clairs phasing
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
44dd4ff144
clairs
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
02ec23c7ae
clean
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
bbc7d3ebf2
c
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
46f19b16f5
ok
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
494efb6235
run
|
před 1 rokem |
