 Thomas
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dce4a111cc
nanomonsv -> mediumq; GATK ok
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vor 5 Tagen |
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Thomas
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9ddb488f87
robuster epilog parsing
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vor 6 Tagen |
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Thomas
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f216c34dce
reduced clairS threads; added slurm_max_par default: 10; use of run! and run_many! in bam import
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vor 1 Woche |
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Thomas
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e5838fa74e
lim s batch para
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vor 3 Monaten |
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Thomas
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66faf6060c
upgraded jobs names with part index
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vor 3 Monaten |
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Thomas
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d17bbe3ad5
limit clairs threads
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vor 3 Monaten |
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Thomas
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a6e037983f
limit max sbatch in paral for run_many_sbatch
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vor 3 Monaten |
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Thomas
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fbb733ef00
prom runs
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vor 4 Monaten |
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Thomas
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a020475b87
fbinv
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vor 4 Monaten |
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Thomas
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9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
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vor 4 Monaten |
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Thomas
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b135d60d4e
callers
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vor 4 Monaten |
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Thomas
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5e4e7c0275
run and run_many macro
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vor 4 Monaten |
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Thomas
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0409a892e8
ClairS slurm
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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0d26c83b3e
BcfTools Slurm
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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40524fefc7
Update runs for unligned BAM files and not only POD5
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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671e2ea3db
no warning
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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ba99b771cc
rm collections
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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4de4f971fe
In the CLUSTER !!!
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vor 5 Monaten |
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Thomas
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93ee5d1c5e
up dorado
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vor 9 Monaten |
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Thomas
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b692aefa9a
clairs phasing
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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44dd4ff144
clairs
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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02ec23c7ae
clean
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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bbc7d3ebf2
c
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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46f19b16f5
ok
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vor 1 Jahr |
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Thomas
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494efb6235
run
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vor 1 Jahr |
