 Thomas
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44149034a2
Counts : speed improvment on materliaze Bin
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hace 4 días |
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Thomas
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f41fecec66
Counts: fw/rev depths / Outliers
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hace 5 días |
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Thomas
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1e239d300d
win rm openmp
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hace 3 semanas |
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Thomas
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72afaddbd7
win rm openmp
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hace 3 semanas |
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Thomas
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83755fc92c
counts at with tabix on counts files
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hace 3 semanas |
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Thomas
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7941d95fdc
depths
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hace 3 semanas |
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Thomas
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d4d41ffee1
uniqueness with cache
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hace 1 mes |
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Thomas
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95fa2ee8f2
alphabet efinition fo libsais
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hace 1 mes |
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Thomas
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fb9402b49e
use of sais suffix array on whole genome
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hace 1 mes |
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Thomas
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be50e652d3
uniqueness update with RC
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hace 1 mes |
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Thomas
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3d0a9c7f9c
uniqueness update with RC
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hace 1 mes |
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Thomas
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d4f245d08f
Removed run_many! from deep_somatic;rs
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hace 1 mes |
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Thomas
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f300248541
FaiReader TabixReader
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hace 1 mes |
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Thomas
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43e3164ef5
FaiReader TabixReader
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hace 1 mes |
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Thomas
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3fc08272ad
nanomonsv norm
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hace 1 mes |
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Thomas
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24d129c5a8
colorsdb update
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hace 1 mes |
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Thomas
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0aaeaf8ce8
colorsdb annotation
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hace 1 mes |
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Thomas
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2a7460a44d
dbsnp parse even if no FREQ and echtvar use exec_jobs
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hace 1 mes |
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Thomas
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65a90d09ee
dbsnp
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hace 1 mes |
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Thomas
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e454674804
todo: dbsnp doesnt report that
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hace 1 mes |
 STEIMLE Thomas
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c3d27c4862
pandora file reader now accept any reader with Trait
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hace 1 mes |
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Thomas
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2372c77e2b
small modif
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hace 1 mes |
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Thomas
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3c15a2820a
bam annotation par
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hace 1 mes |
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Thomas
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f11370f0cf
gatk modif to use exec multiple jobs
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hace 1 mes |
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STEIMLE Thomas
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66b85fb388
Representation
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hace 1 mes |
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STEIMLE Thomas
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a607deb4ca
pandora container doc
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hace 2 meses |
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STEIMLE Thomas
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b28f23a056
refine somatic pandora output
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hace 2 meses |
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STEIMLE Thomas
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ff6cea3cb3
Use local Cargo config for Windows htslib patches
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hace 2 meses |
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Thomas
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334057b7e1
merge
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hace 2 meses |
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STEIMLE Thomas
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1fcf1c5c22
Apply formatting cleanup
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hace 2 meses |
