This website works better with JavaScript
Etusivu
Tutki
Apua
Rekisteröidy
Kirjaudu sisään
Thomas
/
pandora_lib_promethion
Tarkkaile
1
Äänestä
0
Fork
0
Tiedostot
Ongelmat
0
Pull-pyynnöt
0
Wiki
Ei kuvausta
47
Commitit
1
Haarat
0
Julkaisut
Puu:
12f24b0405
Haarat
Tagit
master
pandora_lib_pro...
HTTPS
SSH
ZIP
TAR.GZ
Thomas
12f24b0405
callers: savana, severus; traits: Run (stderr and stdout log and print), Initialize (global config), Version, HasOutput
1 vuosi sitten
src
12f24b0405
callers: savana, severus; traits: Run (stderr and stdout log and print), Initialize (global config), Version, HasOutput
1 vuosi sitten
.gitignore
494efb6235
run
1 vuosi sitten
Cargo.lock
b692aefa9a
clairs phasing
1 vuosi sitten
Cargo.toml
b692aefa9a
clairs phasing
1 vuosi sitten
README.md
e0894f5af7
bcftools keep only in a + modkit pileup
1 vuosi sitten
README.md
Install
Dependencies
For building required HTSlib:
sudo apt install cmake libclang-dev
minimap2
(samtools)[
https://www.htslib.org/download/
]
(dorado)[
https://github.com/nanoporetech/dorado
]
(bcftools)[
https://www.htslib.org/download/
]
(modkit)[
https://github.com/nanoporetech/modkit
]
VEP: cf pandora_lib_variants for VEP install
nanomonsv (cf dependencies at github, TODO: use racon) ###