Thomas - Gogs

Thomas

Paris
https://t0m4.fr
Присоединился Jun 25, 2018
0 Подписчики - 0 Подписан

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

2a7460a44d dbsnp parse even if no FREQ and echtvar use exec_jobs

6 часов назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

65a90d09ee dbsnp

8 часов назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

e454674804 todo: dbsnp doesnt report that

10 часов назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

c3d27c4862 pandora file reader now accept any reader with Trait

14 часов назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

2372c77e2b small modif

15 часов назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

3c15a2820a bam annotation par

4 дней назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

f11370f0cf gatk modif to use exec multiple jobs

1 неделя назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

66b85fb388 Representation

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

a607deb4ca pandora container doc

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

b28f23a056 refine somatic pandora output

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

ff6cea3cb3 Use local Cargo config for Windows htslib patches

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

334057b7e1 merge

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

1fcf1c5c22 Apply formatting cleanup

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

52d9e6486b Add block-compressed Pandora variant index

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

fdc969a486 Add Pandora reader and Windows curl patch
87009c3474 Add Pandora SomaticPipe output container
Просмотр сравнение для этих 2 коммитов »

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_assembler

0a2145264f Add Windows htslib patch setup

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_assembler

3d241b7dbc Upgrade rust-htslib to 1.0.0

2 недель назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

4bbbc66981 Introducing new executor that takes a Vec<Vec<AnyJob>> and treat the inner vec as a sequence.jobs_seq![..] helps to define this sequence from any job that implement LocalRunner and SbatchRunner. ClairS implementation and new resume chunked (TODO: add clairs_allow_resume in config.

1 месяц назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

1c81c5bf58 update longcallD merge BAM

1 месяц назад

Thomas запушил(а) master в Thomas/pandora_lib_promethion

bf12d05d90 longcallD
3ea0a26d87 multiallelic normalization (just for INFO FREQ of dbsnp) for fetch_vcf, prefer normalized vcf...
Просмотр сравнение для этих 2 коммитов »

1 месяц назад