 Thomas
|
4bbbc66981
Introducing new executor that takes a Vec<Vec<AnyJob>> and treat the inner vec as a sequence.jobs_seq![..] helps to define this sequence from any job that implement LocalRunner and SbatchRunner. ClairS implementation and new resume chunked (TODO: add clairs_allow_resume in config.
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
e8875b045d
audit io helpers
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
d6250eeae7
coral
|
před 1 měsícem |
|
Thomas
|
66faf6060c
upgraded jobs names with part index
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
93f5594588
rm lock in chunked run fn
|
před 4 měsíci |
|
Thomas
|
211191d148
doc update
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
30faf74aa1
nanomonsv MA
|
před 5 měsíci |
|
Thomas
|
e516dd6b4d
nanomonsv tested
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
8e7e1df6bc
Update callers and config
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
116b2d7111
vcf_variants
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
cab2f12c20
callers staglr
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
9db8c5ef4b
all callers implemented for slurm. testing in progress
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
c0060e3f5a
callers
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
b135d60d4e
callers
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
848e7845ba
deep_somatic update
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
1f42f2b8ef
Pod5sFlowCell
|
před 6 měsíci |
|
Thomas
|
37caffae61
upate version checker
|
před 7 měsíci |
|
Thomas
|
cf7c41a98c
dorardo up and emit-moves
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
6e963786e3
no gvcf for deep callers
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
3604b225cf
BND to del
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
74c6f4da7b
bam alt/depth
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
23d0e0ea17
Trinucleotides and Early/Late annotations
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
a5880b4b84
caller bug // callers shoud run info // remove_dir_if_exists
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
3700d19af7
Label Trait and impl
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
03ec589273
macro and function for trait Should Run
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
91cde944f4
rationalization adn documentation of callers functions
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
8ff2dc0b66
up alt cat
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
04ca65ee34
better err propagation; new jq consequence filter
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
605ee768fb
json somatic stats
|
před 1 rokem |
|
Thomas
|
a1b3c01b01
Integration to somatic pipe Severus Savana DeepSomatic / LongPhase up
|
před 1 rokem |
